Nova analiza rijetkog argentinskog šoka otključava porijeklo najvećeg genoma sisavaca

Uspon Turske (Lipanj 2019).

Anonim

Novi biološki podaci sakupljeni od crvenog vizcacha štakora, domaće vrste Argentine, pokazuju kako genomi mogu brzo promijeniti veličinu.

Istraživači sa Sveučilišta McMaster krenuli su istraživati ​​ovu vrstu jer je njegov genom, ili njegov kompletan DNK, najveći od svih sisavaca, i čini se da se vrlo brzo povećao.

Genom štakora je otprilike dva i pol puta veći od ljudskog genoma, uključujući 102 kromosoma u odnosu na 46 za ljude, a oko dvostruko veći od jednog od najbližih rođaka, planinskog vizcacha štakora. Najnoviji zajednički predak ove vrste postojao je prije samo oko pet milijuna godina.

"Ova genomska transformacija je upečatljiva jer se to dogodilo u vrlo kratkom vremenu u evolucijskim terminima", kaže Ben Evans, biolog u McMasteru i glavni autor novog istraživanja objavljenog u časopisu Genome Biology and Evolution.

Mehanizam iza tog rasta izazvao je veliku raspravu među znanstvenicima, od kojih neki sugeriraju da je brzo širenje zbog umnožavanja cijelog genoma kada se cijeli niz DNK udvostručuje.

Dvije duplikate genoma su relativno česte u nekim skupinama kao što su biljke - dogodilo se u predjelima kukuruza, duhan, krumpir i mnoge druge biljke cvjetnice, kažu istraživači.

Drugi tvrde da je širenje brzog genoma štakora posljedica ponavljajućih DNA-bitova DNA koji se mnogo puta ponavljaju u genomu povezanom s kromosomskom fijevu, proces u kojem se jedan kromosom dijeli na dva ili više evolucijskog vremena.

Da bi riješili raspravu, istraživači su uspoređivali i uspoređivali genomske skupove podataka s crvenog vizcakova štakora i planinskog vizcacha štakora.

Njihova analiza sugerira da je genom brzo rastao zbog širenja različitih skupova visoko repetitivnih elemenata, a nisu pronašli nikakav jaki dokaz dupliciranja genoma.

"Ovo je zanimljivo jer ti isti mehanizmi - širenje repetitivne DNK - djeluju na ljude i doprinose" genomskoj prtljagu "ili dodatnoj DNK, što može utjecati na bolest kroz prekid genske funkcije", kaže Evans.

Ipak, ostaju mnoga pitanja. Istraživači se nadaju daljnjem karakteriziranju prirode tih ponavljajućih elemenata. Na primjer, što su oni i zašto su se proširili? I još se širi?

Istraživači također planiraju istražiti je li to genetsko evoluiranje odigralo ulogu u visokoj toleranciji štakora za vrlo slanu prehranu. Ova vrsta može se hraniti na izuzetno slanim biljkama koje rastu u pustinjskom staništu, dok planinski vizcacha štakor ne može tolerirati istu prehranu.

menu
menu