Tim otkriva cijelu genomsku sekvencu rijetkog crvenog šišmiša

Richard Resnick: Welcome to the genomic revolution (Lipanj 2019).

Anonim

Nedavna studija, povezana s Korejskim institutom za industrijalizaciju i komercijalizaciju genoma (KOGIC) na ulsanskom nacionalnom institutu za znanost i tehnologiju (UNIST) u Južnoj Koreji, predstavila je prvu cjelovitu genomsku sekvencu i analizu Myotis rufonigera, jednog od najpoznatijih i ikonastih zaštićenih divljih životinja u Južnoj Koreji, poznatoj kao zlatni šišmiš.

Ovaj proboj dolazi od istraživanja koje je proveo profesor Jong Bhak iz Life Science na UNIST-u i profesor Doug-Young Ryu iz veterinarske medicine na Seoul National University u suradnji s korejskom kulturnom baštinom.

Nedavne studije pokazale su da šišmiši žive dulje od bilo kojeg drugog sisavca njihovih veličina na zemlji. Myotis rufoniger je vrsta vesper šišmiša u obitelji Vespertilionidae. To je rijetka vrsta šišmiša koja se suočava s neposrednom prijetnjom nestanka s lica Zemlje. Imenovan kao korejski prirodni spomenik br. 452, samo 450 do 500 tih šišmiša danas preživljava u divljini u Južnoj Koreji. Tim istraživača očekuje da će ova studija pružiti genetsku osnovu za obnovu i očuvanje kritično ugroženog M. rufonigera.

U svojoj studiji, objavljenoj u srpnju broju najvećeg znanstvenog časopisa u svijetu, PLOS ONE, istraživački tim, koji je vodio istraživački tim profesora Bhak, pruža cjelovitu genomsku analizu M. rufonigera, proizvodnjom masivno kratkoročnih sekvenci DNA sa svojim genomskim značajkama i jedinstvene aminokiselinske sekvence, popraćene demografskom poviješću i genetskom raznolikošću.

Genomska DNA iz divljeg leša M. rufonigera pronađena u Gosudonggul špilji, Danyang, u Južnoj Koreji, upotrijebljena je u ovoj studiji za istraživanje demografske povijesti Myotis šišmiša. Istraživački tim također je istražio genomsku raznolikost M. rufonigera i uspoređivao ga s onima ostalih 13 genoma sisavaca (sedam bat genoma i šest drugih genoma sisavaca).

Istraživački tim je potvrdio da ti šišmiši također imaju sekvence specifične za šišmiše koje su već objavljene kako bi se povezivale sa zakašnjelom ovulacijom šišmiša tijekom hibernacije, dugim vijekom trajanja, letačima, echolocationom i slabim vidom. S obzirom na dug životni vijek šišmiša, genetska struktura M. rufonigera pridonijet će boljem razumijevanju ljudske dugovječnosti.

Šišmiši su obično smeđe ili crne boje, ali se također pojavljuju u različitim shemama boja. U istraživanju je istraživački tim pronašao specifične genetske varijacije koje su najvjerojatnije odgovorne za boju ružičaste narančaste boje M. rufonigera, koje ga razlikuju od ostalih šišmiša. Štoviše, također su otkrili da je elementalna analiza u tkivima iz analizirane osobe M. rufoniger također pokazala vrlo visoku koncentraciju (As) u svom crijevnom tkivu. To ukazuje na evolucijsku povezanost koju M. rufoniger može preživjeti u špilji, sadržavao visoku razinu As.

Genom sadrži sve genetske podatke određenog organizma, uključujući i evolucijsko podrijetlo. Analiza demografske povijesti u ovoj studiji pokazala je da je veličina populacije M. rufonigera dramatično smanjena tijekom posljednjeg dijela prošlog glacijalnog razdoblja. Također je pokazano da je postojao dosljedan pad efektivne populacije obitelji Myotis šišmiša od prije 30 k godina. Konkretno, M. rufonigerova učinkovita populacija bila je najniža u Myotis šišmiši, potvrđujući njegovu relativno nisku genetsku raznolikost.

"Glavni razlog brzog pada stanovništva šišmiša posljedica je nedavnog utjecaja čovjeka i uništavanja divljih životinja", rekao je YoungJune Bhak, glavni autor studije. "Potrebne su daljnje studije kako bi se utvrdilo je li pad populacije šišmiša u ovom istraživanju fenomen šišmiša, kao i saznati koji su mogući načini za sprječavanje brzog pada populacija šišmiša."

"Šišmiši su jedan od najvrjednijih bioloških resursa zemlje za ljude, budući da su biološki zanimljivi kao kitovi i također imaju relativno dug životni vijek", kaže profesor Bahk. "Moramo pretvoriti ove genomske podatke u korisne informacije koje poboljšavaju zdravlje pojedinca i stanovništva".

Dodaje: "Nadamo se da ćemo razotkriti osnovu za nedjelotvornost pronalaženjem genetskih lokusa povezanih s ekstremnim nedostatkom u genom šišmiša, i dalje ga iskoristiti za liječenje raka i produljenje ljudskog života".

menu
menu